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第五十三章 批量操作

我有科研辅助系统 | 作者:肥美的韭菜 | 更新时间:2021-01-09 00:11:56
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  “光源数据是tif格式文件,是一个由3072*3072个点组成的灰度图,其中每个点除了横纵坐标外,还有一个信号强度值。

  拿到这些数据后,第一步,我们要确认圆心坐标、标定样品离检测器距离。

  打开fit2d软件,导入六硼化镧的文件,它的图像是一组同心圆。

  通过软件拟合,可以确认它的圆心坐标,此外,还可以计算出样品离检测器距离,这两个数据在之后制图过程中要用到。

  第二步,导入样品文件以及对应曝光时间的空白硅片文件,然后对两个文件做差值,即可扣除背景信号。

  空白硅片的图像是这种半圆形的信号,如果背景扣除的效果不好,还残留明显的硅片的信号,我们就需要进一步的处理。

  首先在样品图像中,找到有硅片信号但几乎没有样品信号的地方,随意选一个点,记录其强度。

  然后在空白硅片图像的同样位置,查看那个点的强度。

  接着将空白基片所有数据点的强度乘一个系数,使之前选择的两个点的强度相等。

  最后对两个文件做差值,就能将背景信号扣除干净。

  第三步,将处理好的文件导出,格式仍然是tif,之后的数据处理都是基于这个文件的。

  第四步,积分。

  我们得到的是一个二维的图片,对于有机聚合物材料来说,其主要的“分子堆砌结构”信息,都在图片的坐标轴附近。

  其中横轴代表平面内的方向,表示为qxy,而纵轴代表垂直于平面的平面外的方向,表示为qz,单位都是埃的负一次方。

  因此,我们对坐标轴附近的数据点强度进行积分,得到两个积分曲线,就可以分别分析在平面内和平面外的“分子堆砌结构”信息了。

  具体的积分角度一般是0-3度和88-92度。

  第五步,将灰度图片,用ps软件处理,将其转化为彩色图片,用不同的颜色表示数据点的强度,再加上坐标轴,图例等。”

  前面几步的操作,陈婉清和罗阳相差不大。

  直到最后一步,学姐拿出了ps软件。

  许秋终于找到她慢的原因了。

  “学姐,最后ps这一步可以用编程来实现批量操作,不需要一张张的p图。”许秋道。

  “我也听说可以批量导出图片,”陈婉清无奈的摊摊手:“可是我不会编程啊。”

  “我会,交给我吧,”许秋道:“把最终的效果图发我,我来研究一下。”

  “真的嘛?要是能成功的话,可以省下不少时间呢。”陈婉清将信将疑,把图片发给许秋。

  “等我的好消息。”许秋自信满满道。

  他启动电脑的matlab软件,目光看向效果图,做出思考状。

  然后,打开辅助系统,查看系统影像中的程序代码,逐行分析它们的功能。

  因为有注释的存在,所以没过多久,许秋就弄明白了程序运作的原理。

  不过,其中有一步属于超纲知识。

  于是,许秋向陈婉清‘请教’道:

  “学姐,图片的坐标轴标尺怎么确定呢?”

  “根据样品和检测器的距离以及x射线的波长,可以计算得出,公式为……”陈婉清道。

  “我明白了。”

  许秋点点头,然后把系统影像中的代码,输入到自己电脑的matlab软件中。

  他一边码代码,一边向陈婉清讲解道:

  “这个程序主要分为三步:

  第一步,通过之前标定的圆心坐标、样品和检测器的距离,以及x射线的波长这些数据,计算得出坐标原点的位置、坐标轴标尺。

  第二步,将每个数据点的信号强度,转化为rgb颜色数据,这个可以直接套用matlab里自带的jet颜色模型。

  这个模型是信号强度越大,转化后的颜色就越红,信号强度越小,转化后的颜色就越蓝。

  第三步,自动保存图片到指定文件夹,然后设置一个批量操作命令。”

  代码只有短短几十行,所以许秋很快就输入完毕。

  “思路倒是很清晰,”陈婉清基本上已经相信了许秋的话,不过还是问道:

  “只有这些代码,就能实现批量操作吗?”

  “我来演示一下吧,毕竟眼见为实。”许秋道:

  “就直接拿原始没有扣过背景信号的数据做演示好了。

  首先,把待处理的文件按样品编号统一命名为:1.tif、2.tif、3.tif,我们先用3个文件测试一下。

  然后,将圆心坐标、样品和检测器的距离以及x射线的波长这些数据手动输入进去。

  最后,点击运行就可以了。”

  许秋点击运行按钮后,电脑屏幕上弹出了运算的对话框,上面的数字在不断的滚动。

  几十秒后,第一张图片处理完成。

  自动保存后,软件继续运行,开始处理第二张图片。

  两分钟后,三张图片均处理完成,许秋从文件夹中将它们打开。

  陈婉清看到成品图片后激动不已:“真的可以啊,这和我ps出来的没什么差别,而且用ps手动p图有时候还会出错。”

  “对了学弟,这个方法可不要让魏老师知道啊。”她补充道。

  “为什么呢?”许秋不解。

  “他如果知道的话,以后测完光源数据,就会让我们当天把实验数据处理出来了,”陈婉清摊手道:“通宵测试完,我还想划划水呢。”

  “好吧,我一定守口如瓶。”许秋道:

  “那数据我们各处理一半吧,先只扣除背景和计算积分,最后全部弄完,再统一用matlab导出彩图。”

  “好呀,那我从1号样品开始,正序处理数据,你从72号样品开始,倒序处理,怎么样?”陈婉清道。

  “可以。”

  …………

  两个小时后,许秋将37号样品处理完毕,侧过头看了眼学姐的进度,还在31号样品,便说道:

  “学姐,我37号处理完了,再帮你分担3个吧,你弄到33号就可以了,34、35、36交给我。”

  “你好快啊,那就拜托你啦。”陈婉清道。

  两人将最后几个数据处理完后,陈婉清将她的数据拷贝到许秋电脑上,因为她没有安装matlab软件。

  许秋操作电脑,批量导出彩图,没有发生意外。

  “今天多亏学弟帮忙,这么快就弄好啦,晚上请你吃饭,食堂。”陈婉清开心道。

  “好呀,不过明天就是保研面试,吃完饭我就直接回寝室了。”

  “嗯嗯,学弟加油哦。”
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